單細胞轉錄組產(chǎn)品
人基因組重測序可全面掃描人類(lèi)基因組上的變異信息,一次性挖掘大量的生物標記物,該技術(shù)準確性高、可重復性好、定位精確,已被廣泛應用于疾病、癌癥的基因組研究。
10x Genomics單細胞轉錄組
利用油包水的微反應體系,通過(guò)序列標簽區別群體中的不同細胞,獲得單細胞水平的數字化基因表達譜,實(shí)現數千甚至數萬(wàn)個(gè)單細胞群體分析。
SeekOne DD單細胞轉錄組
利用SeekOne?DD微流控平臺在單細胞水平上對 mRNA 進(jìn)行高通量測序和分析,能獲得單個(gè)細胞內基因表達信息,為辨別生物組織中各種細胞類(lèi)型的轉錄組特征提供有力的工具。
10x Genomics單細胞基因表達Flex
不僅適配FFPE樣本,還能夠鎖定新鮮樣本的細胞狀態(tài),在不犧牲樣本完整性或數據質(zhì)量的情況下采集樣本、運輸到中心實(shí)驗室并開(kāi)展分析,打破了樣本限制,釋放各類(lèi)樣本的單細胞研究潛能。
10x Genomics單細胞V(D)J
在單細胞水平同時(shí)實(shí)現免疫組庫分析(TCR和BCR)和5’端基因表達譜分析,在解析免疫組庫多樣性,探索T/B細胞特異性抗原,描述腫瘤微環(huán)境等研究中有廣泛應用。
10x Genomics單細胞GEM-X
以Chromium X平臺作為技術(shù)承載,推出單細胞基因表達(3’)v4版本和單細胞免疫組(5’)v3版本兩款產(chǎn)品,對單細胞轉錄組和單細胞免疫組庫各方面性能進(jìn)行了全面升級。
單細胞全長(cháng)轉錄組
可同時(shí)實(shí)現單細胞水平的基因表達定量和全長(cháng)轉錄本可變剪切信息的獲取,為探索疾病發(fā)生發(fā)展的分子機制提供強大的技術(shù)支撐。
10x Genomics單細胞ATAC/多組學(xué)
可以同時(shí)獲得同一細胞的基因表達和染色質(zhì)可及性圖譜,提供同一細胞基因表達信息及其表觀(guān)基因組景觀(guān)的統一視圖;識別差異基因表達的驅動(dòng)因素,揭示調控元件、開(kāi)放染色質(zhì)和基因表達之間復雜的相互作用。
應用方向
- 組織圖譜:繪制不同器官和組織的細胞圖譜;有助于理解健康和疾病狀態(tài)下的細胞組成和功能;
- 發(fā)育分化:監測發(fā)育不同階段的細胞轉錄活動(dòng),對于理解組織發(fā)育和再生、以及干細胞科學(xué)至關(guān)重要;
- 腫瘤研究:識別和分類(lèi)腫瘤內的異質(zhì)細胞群體,包括癌細胞和腫瘤微環(huán)境中的其他細胞類(lèi)型(如免疫細胞),有助于揭示腫瘤的發(fā)展、擴散機制以及對治療的響應;
- 免疫研究:在單細胞層面上詳細分析免疫細胞的狀態(tài)和功能,識別不同的免疫細胞亞型和它們在免疫反應中的作用,對于開(kāi)發(fā)針對感染、炎癥以及自身免疫疾病的新療法具有重要意義;
案例解析

人和小鼠HCC癌癥相關(guān)成纖維細胞圖譜
單細胞測序揭示癌相關(guān)成纖維細胞為肝細胞癌提供免疫抑制微環(huán)境
肝細胞癌(HCC)是一種具有高度細胞異質(zhì)性的惡性腫瘤。該研究利用單細胞轉錄組測序技術(shù)分別對人和小鼠的肝細胞癌腫瘤免疫微環(huán)境進(jìn)行高精度觀(guān)測,在單細胞水平上系統全面地繪制了人和小鼠HCC癌癥相關(guān)成纖維細胞(CAFs)圖譜及亞群特征。并確定了CD36在CD36+CAFs中通過(guò)脂質(zhì)過(guò)氧化/p38/CEBPs軸介導氧化性L(fǎng)DL攝取依賴(lài)的MIF表達,進(jìn)而促進(jìn)免疫抑制性腫瘤微環(huán)境的形成以及腫瘤細胞的擴增等。并且,作者通過(guò)一系列的驗證,揭示靶向CD36可有效提高免疫治療的療效。該研究不僅深入地挖掘了腫瘤相關(guān)成纖維細胞關(guān)鍵亞型在促腫瘤過(guò)程中的分子機制,還為克服免疫抑制性腫瘤微環(huán)境、提高臨床免疫治療及細胞治療療效提供了堅實(shí)的數據支撐。
參考文獻:Zhu G Q, Tang Z, Huang R. et al. CD36+ cancer-associated fibroblasts provide immunosuppressive microenvironment for hepatocellular carcinoma via secretion of macrophage migration inhibitory factor [J]. Cell Discovery. 2023 Mar 6;9(1):25.